Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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