Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrde2Q80XC6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nrde2Q80XC6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms