Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sestd1Q80UK0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sestd1Q80UK0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms