Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

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Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp8Q80U87 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp8Q80U87 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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