Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Phf8Q80TJ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf8Q80TJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms