Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctdp1Q7TSG2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms