Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms