Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp397Q7TNK4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms