Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shq1Q7TMX5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Shq1Q7TMX5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Shq1Q7TMX5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Shq1Q7TMX5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shq1Q7TMX5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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