Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcg2Q7TMS5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms