Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwistnbQ78WZ7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms