Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmed3Q78IS1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmed3Q78IS1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms