Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SynmQ70IV5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms