Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms