Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Syne1Q6ZWR6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Syne1Q6ZWR6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC5.03□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Syne1Q6ZWR6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Syne1Q6ZWR6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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