Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms