Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb3Q6XAS4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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