Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssx9Q6XAS3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms