Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms