Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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