Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfrlQ6PE55 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms