Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vstm2lQ6PDS0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms