Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp49Q6P9L4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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