Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smchd1Q6P5D8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smchd1Q6P5D8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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