Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PrimpolQ6P1E7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms