Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms