Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpbp1Q6NXH3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms