Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CltbQ6IRU5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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