Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm4Q6IRU2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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