Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt39Q6IFX4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms