Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Carmil1Q6EDY6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Carmil1Q6EDY6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms