Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarca2Q6DIC0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms