Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gbf1Q6DFZ1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gbf1Q6DFZ1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gbf1Q6DFZ1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbf1Q6DFZ1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms