Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nop58Q6DFW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nop58Q6DFW4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms