Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q6DFW0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q6DFW0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms