Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rftn1Q6A0D4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms