Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3rf1Q69ZI1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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