Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Pkp4Q68FH0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Pkp4Q68FH0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Pkp4Q68FH0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp4Q68FH0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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