Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms