Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp4eQ66X19 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp4eQ66X19 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms