Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top2bQ64511 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top2bQ64511 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms