Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtprdQ64487 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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