Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms