Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms