Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ndufa4Q62425 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ndufa4Q62425 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms