Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six2Q62232 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six2Q62232 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms