Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms