Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp1Q62209 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms