Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RhocQ62159 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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RhocQ62159 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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RhocQ62159 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RhocQ62159 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RhocQ62159 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RhocQ62159 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RhocQ62159 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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