Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms